Читать «Эпигенетика» онлайн - страница 740
Чарльз Дэвид Эллис
Эндонуклеазы, переключение типа спаривания и, 74-75
Энзимы, 18, 21, 29, 40, 46-48.
Энхансеры
— zeste (E(Z)) семейство, 96, 179-180, 214, 224, 296-297
— аллельное исключение, 397
— мозаичности (E(var)), 90-92
— сайленсинг у
Эпиаллели, 36, 177
Эпигенез, 369, 372
Эпигенетика, определение, 13, 27, 34, 38-39
Эпигенетическая память. См. Клеточная память
Эпигенетические импринты, определение, 298, 299
Эпигенетические методы терапии, для раковых заболеваний, 459-461
Эпигенетические состояния, определение, 38
Эпигенетический код, 38
Эпигенетический контроль, 62-64, 75-77
Эпигенетический ландшафт, развитие, 39
Эпигеномы, определение, 424
Эпимутации, болезни человека и, 437
Эписостояния, TSA-индуцированный сайленсинг и, 113
Эпифенотипы, 35
Эритроидные клетки, CMPs и, 390
Эссенциальный (Е) сайленсер, 77-78
Эстрогенный сигналинг, метилирование аргининов и, 201
Эухроматин
— H3K27 метилирование и, 200
— H3K4 метилирование и, 196-197
— H3K9 метилирование и, 198-200
— гетерохроматин vs., 44-46, 97, 100, 177
— «молчащий» хроматин и, 57
— определение, 34, 40, 71
Я
Ядерная организация, общий обзор, 20-21
Ядерная эквивалентность, 405
Ядерный диморфизм, 36, 131, 135-136
Ядрышковое доминирование, 177
Яйцеклетки, 377, 407, 417-418
Яровизация (VRN), 180, 188, 214, 216-217
Брно-номенклатура для модификаций гистонов
a Использование строчных букв для обозначения модификаций помогает отличать их как от аминокислот (идентифицируемых по их однобуквенным кодовым обозначениям), так и от гистонов (таких, например, как Н2А), для которых всегда используются прописные буквы.
b Номенклатурное обозначение начинается (слева направо) с гистона, затем пишется остаток, затем — модификация. В тех случаях, где модифицированный остаток не известен или не важен, модификация должна следовать за гистоном, например: Н4ас и Н2Ваг1. Множественные модификации можно обозначать, просто расширяя список (например, H3K4me 3K9ac S10ph ...) по мере необходимости. Поскольку каждый отдельный модифицированный остаток начинается с прописной буквы, обозначающей аминокислоту, и поскольку сами модификации все обозначаются строчными буквами, нет необходимости в использовании запятых или точек, чтобы разделять отдельные модифицированные остатки в «слове», обозначающем комбинацию остатков; в этом случае остаток следует вставлять без добавлений (например, H3K9S10ph, чтобы указать H3, не модифицированный по Lys-9 и фосфорилированный по Ser-10).
c Полиубиквитилированные гистоны обозначаются ubn.
d В настоящее время гипотетично.
С изменениями и с любезного разрешения из: Turner В.М., Nat. Struct. Mol. Biol. 12: 110-112. (2005).
Эпигенетические механизмы, действующие у разных модельных организмов
Сокращение: (Hs) —
a Эпигенетическая особенность считается имеющейся на основе гомологии последовательностей, но не функциональных данных.
б Имеются данные, что метилирование H3K9 обнаруживается в районах активного хроматина; однако функциональное значение этого не известно.
